基于TCGA数据库分析JMJD6在肝癌组织中的表达及临床意义

• 作者: 赵冉 武燕洁 刘振凤 冯圣鋆 兰蓓
• 来源期刊: 天津医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: TCGA 肝癌 JMJD6 预后分析
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 生物信息学专题
• 页码范围: 15-19
• 页数: 5页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文

摘要

目的:分析JMJD6在肝癌中的表达及与预后的关系.方法:从TCGA数据库中下载肝癌患者的mRNA表达数据及患者临床信息.利用Wilcoxon检验比较肝癌组织和正常组织中JMJD6的表达差异,单因素Logistic回归分析JMJD6表达量与临床特征的关系.通过Kaplan-Meier法和Cox回归分析JMJD6表达量与患者生存率的关系.将肝癌组织分成JMJD6高表达组和低表达组并进行基因集富集分析(GSEA).结果:与正常组织相比,JMJD6在肝癌组织中高表达(W=2506,P<0.001),且表达量与临床分期和病理分级相关(均P<0.05).JMJD6高表达导致患者生存率下降(χ2=5.541,P<0.05),并且是肝癌患者预后的独立危险因素(HR=1.109,95％CI:1.039～1.184,P<0.01).此外,GSEA结果显示JMJD6高表达组在DNA复制、RNA剪接等通路富集,低表达组在脂肪酸和氨基酸代谢通路富集.结论:JMJD6高表达与肝癌的发生、发展及患者不良预后相关.