陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证

• 作者: 王琴琴 陈修贵 陆许可 王帅 张悦新 范亚朋 陈全家 叶武威
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 GhPKE1 生物信息学分析 VIGS
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术生命科学|BIOTECHNOLOGY & LIFE SCIENCE
• 页码范围: 38-45
• 页数: 8页
• 分类号: S562
• 语种: 中文
• DOI: 10.13304/j.nykjdb.2020.1054

摘要

为研究棉花重金属结构域基因GhPKE1在棉花中的作用,采用生物信息学方法对GhPKE1 DNA序列的结构特性及其编码蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等进行分析,并根据GhPKE1的结构特点构建了GhPKE1的病毒诱导基因沉默(VIGS)载体侵染棉花.结果 表明,GhPKE1基因序列全长1048 bp,蛋白质相对分子质量27.54 kD,等电点9.3,不稳定系数35.56.分别用硫酸钠(Na2SO4)和氯化镉(CdCl2)胁迫处理沉默GhPKE1的三叶期棉苗,处理后植株表现出明显的表型差异.qRT-PCR表达模式分析表明,用pYL156:GhPKE1侵染过的棉花中GhPKE1转录水平与对照相比显著降低;与对照相比,沉默GhPKE1棉花幼苗的抗Na2SO4和抗CdCl2性显著减弱.综上所述,GhPKE1基因在棉花响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,为进一步研究棉花的抗逆机制奠定基础.