水曲柳FmPIF基因家族克隆及表达模式分析

• 作者: 吕义品 梁楠松 宋婷婷 崔靖弘 于磊 詹亚光
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水曲柳 光敏色素互作因子 基因克隆 生物信息分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 林学|Forest Sciences
• 页码范围: 58-68
• 页数: 11页
• 分类号: S718.46|S792.153|Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.12171/j.1000−1522.20200379

摘要

[目的]探究水曲柳光敏色素互作因子(FmPIFs)在激素调控与非生物胁迫应答过程中的重要作用,为揭示水曲柳抗逆分子机制和制定林木遗传育种策略提供理论依据.[方法]在水曲柳中克隆FmPIFs基因,并对其基因结构、蛋白质理化性质、保守基序、系统进化关系等进行生物信息学分析.采用qRT-PCR方法分析水曲柳中FmPIFs基因在不同组织及不同激素与胁迫条件下的表达模式.[结果]获得5个水曲柳FmPIFs基因家族成员,分别命名为FmPIF1、FmPIF3、FmPIF4、FmPIF7和FmPIF8,其对应的蛋白均为亲水性不稳定蛋白,全部定位在细胞核内.多序列比对结果表明FmPIFs均存在APB保守结构域,成员FmPIF1与FmPIF3存在特有的APA结构域.组织特异性分析显示FmPIFs均在叶中表达量最高,其中成员FmPIF8表达量最高,为对照的3.96倍;但在茎中少量表达,茎中表达量最高的是FmPIF3,仅是对照的0.21倍;而在根中表达量均极低.胁迫响应分析表明,FmPIFs正调控水曲柳植株盐、碱和干旱胁迫抗性,而对植株抗寒性起负调控作用,其中成员FmPIF3对寒冷及盐胁迫明显响应,FmPIF8在碱胁迫下表达量明显上调,FmPIF1在干旱胁迫下表达量明显上调.在激素响应结果中,FmPIFs对脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)和赤霉素(GA3)的响应较为一致,而对生长素(IAA)和茉莉酸甲酯(MeJA)的响应存在差异.FmPIF1在施加MeJA后剧烈应答且表达量显著上调,FmPIF7在SA处理后表达量明显上调,FmPIF3和FmPIF4在GA3处理后表达量明显上调.[结论]FmPIFs各成员在基因及蛋白结构上表现出较高的一致性.RT-qPCR结果表明,FmPIFs在水曲柳叶片中表达量最高.在盐、碱、干旱和寒冷胁迫下,FmPIFs被诱导表达,且大部分表达模式相似.FmPIFs也在水曲柳响应IAA、ABA、MeJA、SA、GA3激素调控过程中发挥重要作用.