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马铃薯StASR基因的生物信息学分析及基因克隆
马铃薯StASR基因的生物信息学分析及基因克隆
作者:
王树林
李高峰
张荣
文国宏
李建武
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
ASR基因
干旱胁迫
马铃薯
生物信息学
摘要:
将拟南芥AtASR基因核苷酸序列作为查询序列,在NCBI数据库中进行BLAST比对,得到马铃薯StASR基因(GenBank登录号:XM_006359742)的序列.通过生物信息学分析发现,该基因位于4号染色体上,基因长度为654 bp,编码108个氨基酸残基,其编码的蛋白质具有典型的ABA/WDS保守结构域.启动子区域分析后发现,马铃薯StASR基因含有水分响应元件MYCATERD1、冷胁迫响应元件DRECRTCOREAT和盐胁迫响应元件GT1GMSCAM4等多种与非生物胁迫响应相关元件以及马铃薯生长发育相关顺式作用元件,对其进行蛋白质互作网络的分析发现与低温、水分胁迫等基因互作.用PCR技术成功的克隆到马铃薯StASR基因,其结果可以为深入研究马铃薯StASR基因的功能提供基础.
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文献信息
篇名
马铃薯StASR基因的生物信息学分析及基因克隆
来源期刊
甘肃农业科技
学科
农学
关键词
ASR基因
干旱胁迫
马铃薯
生物信息学
年,卷(期)
2022,(3)
所属期刊栏目
遗传育种|Genetics and Breeding
研究方向
页码范围
20-24
页数
5页
分类号
Q781|S532
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-1463.2022.03.005
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(0)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
ASR基因
干旱胁迫
马铃薯
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
甘肃农业科技
主办单位:
甘肃省农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-1463
CN:
62-1050/S
开本:
大16开
出版地:
兰州市安宁区农科院新村1号
邮发代号:
54-8
创刊时间:
1963
语种:
chi
出版文献量(篇)
7316
总下载数(次)
4
总被引数(次)
20568
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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