侵染大豆的花生斑驳病毒公主岭分离物基因组测序及分析

• 作者: 张春雨 李小宇 王晨 战笑蕾 刘建青 王永志
• 来源期刊: 植物保护
• 学科: 农学
• 关键词: 花生斑驳病毒 基因组 大豆
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 61-65
• 页数: 5页
• 分类号: S435.29
• 语种: 中文
• DOI: 10.16688/j.zwbh.2020544

摘要

本研究利用小RNA深度测序法在大豆叶片上检测到1株花生斑驳病毒Peanut mottle virus (PeMoV),根据小RNA深度测序结果和GenBank公布的PeMoV基因组序列设计引物克隆了PeMoV公主岭分离物(PeMoV-Gongzhuling)的基因组序列.测序结果经拼接后获得了PeMoV-Gongzhuling基因组,大小为9709个核苷酸(Gen-Bank登录号:MT790744).该基因组在第123位—第9422位存在1个大的开放阅读框(ORF),编码1个多聚蛋白(分子量351.28 kD).PeMoV-Gongzhuling与GenBank中已登录的其他PeMoV分离物的基因组的核苷酸序列一致性为95.88％～99.53％,氨基酸序列一致性为97.39％～99.84％,其中与韩国分离物GYBU-92 (MT603819)在核苷酸和氨基酸水平上的一致性均为最高.