CMTM6与肝癌肿瘤微环境密切相关免疫和分子特征的生物信息学分析

• 作者: 张昊 刘怀民 李佳
• 来源期刊: 中华肿瘤防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: CMTM6 PD-L1 肝癌 肿瘤微环境 ECM分子
• 年，卷（期）: 2022,（6）
• 所属期刊栏目: 临床基础研究/论著|CLINICAL BASIC RESEARCH / ORIGINAL ARTICLES
• 页码范围: 414-420
• 页数: 7页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.16073/j.cnki.cjcpt.2022.06.06

摘要

目的 探讨趋化素因子超家族6(CMTM6)在肝细胞癌中的预后价值及与CMTM6密切相关肿瘤微环境的免疫和分子特征,如与程序性死亡受体1配体(PD-L1)、免疫细胞浸润和细胞外基质(ECM)分子的关系.方法 使用癌症基因组图谱(TCGA;包括371例肿瘤组织和50例正常组织)、基因表达综合数据集(GEO;包括43例肿瘤组织与44例正常组织)和肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库等公共数据库,分析肝癌中CMTM6的mRNA表达;分别采用Kaplan-Meier法和Spearman法评估CMTM6的预后价值及其与PD-L1的相关性.使用ESTIMATE算法分析CMTM6表达与肿瘤微环境组成(免疫评分、基质评分和估计评分)之间的关系.分析CMTM6表达与肿瘤微环境中ECM分子之间的相关性.结果 TCGA、GEO数据库中,肝细胞癌组织CMTM6 mRNA表达(4.075±0.536)相对正常组织(4.572±0.252)下调,P<0.001;GEO数据库中,肝细胞癌组织CMTM6 mRNA表达(0.122±0.132)相对正常组织(0.283±0.058)下调,P<0.001;CMTM6在转移性肿瘤组织中的mRNA表达(0.415±0.026)相对非转移性肿瘤组织(0.108±0.156)升高,P<0.001.CMTM6高表达的患者预后较差,无复发生存期(RFS)和总生存期(OS)较短,P值分别为0.038和0.030.ESTIMATE算法的结果显示,CMTM6高表达组免疫评分(388.644±664.858)和基质评分(-737.645±477.871)高于低表达组(631.161±752.627和-531.719±596.130),均P<0.001.CMTM6高表达组肿瘤纯度(0.801±0.111)较低表达组(0.841±0.084)低,P<0.001.在TIMER(r=0.222)和TCGA数据库(r=0.192)中,CMTM6和PD-L1 mRNA表达相关,均P<0.001.在TCGA和GEO数据库中,CMTM6表达与ECM分子如ADAM11、AD-AM19、ADAM28、ADAM8、AKT1、CTSB、MMP11、MMP12和MMP25之间也存在相关性,均P<0.05.除了ADAM11和MMP25之外,TIMER数据库中也显示了类似的结果.结论 CMTM6高表达的患者预后较差,可能是肝细胞癌预后不良的重要因素;CMTM6与PD-L1相关,并与肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞浸润和ECM分子相关.