菜豆花色全基因组关联分析

• 作者: 卢甜甜 刘志远 徐兆生 张合龙 李国亮 折红兵 钱伟
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菜豆 全基因组关联分析 花色 表达
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research Papers
• 页码范围: 332-340
• 页数: 9页
• 分类号: S643.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2021-0056

摘要

以124份菜豆为试验材料,分别在2019年和2020年调查花色表型,利用全基因组关联分析(GWAS)的方法对调控花色的基因进行挖掘.结果 表明:2年间供试菜豆花色表型基本一致,仅有1份材料存在差异.对124份菜豆材料进行重测序共获得517.58 Gb的数据量(10×),通过与菜豆参考基因组比对,获得5130030个SNP,过滤后得到3701584个SNP.利用这些高质量的SNP基于压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)将菜豆花色调控基因定位在6号染色体322.67 kb的区域内;在候选区域内共鉴定到8个基因,其中,Phvul.006G020200为参与花青素调控的MYB转录因子基因,且在不同花色材料中差异性表达,为调控菜豆花色的关键候选基因.