甘蓝型油菜phytocyanin家族全基因组鉴定和表达分析

• 作者: 张帅 林科运 侯纯朴 方玉洁 王幼平
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 质体蓝素 系统发生分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 116-129
• 页数: 14页
• 分类号: S565.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2020341

摘要

质体蓝素(phytocyanin,PC)是一类含铜电子转移蛋白,参与植物光合作用、生长发育以及对环境的适应等.为研究异源四倍体作物甘蓝型油菜的PC基因功能,对BnPC家族进行全基因组鉴定,共鉴定到173个成员.根据铜结合位点以及糖基化位点的差异将该基因家族的蛋白划分为4个亚家族:类早期结瘤素蛋白(BnENODL)、类花青苷蛋白(BnUCL)、类漆树蓝蛋白(BnSCL)和类质体蓝素蛋白(BnPLCL).蛋白质序列特征分析结果表明,133个BnPC含有N端信号肽,77个BnPC具有糖基磷脂酰肌醇锚定信号,87个BnPC具有阿拉伯半乳聚糖结构域,104个BnPC具有N-糖基化位点.共线性分析结果表明,基因组复制和片段重复在该家族的扩张中起着重要作用.表达谱分析结果表明,部分BnPC基因的表达具有组织/器官特异性,95个BnPC基因至少对旱、盐、冷和高温胁迫中的一种产生响应.