甘蓝型油菜FAF基因家族鉴定并挖掘分枝形成相关成员

• 作者: 蒋先润 罗桂林 梁峰豪 黄莎 肖华贵 张超 代文东
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 FAF家族 全基因组鉴定 分枝
• 年，卷（期）: 2022,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告|Articles and Letters
• 页码范围: 847-860
• 页数: 14页
• 分类号: S565.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2022.05.003

摘要

FAF基因家族是植物界特有的转录因子之一,具有调节分生组织大小的作用.为研究甘蓝型油菜(Brassica napus)中FAF基因对分枝形成的影响,本研究对甘蓝型油菜FAF家族成员进行了全基因组鉴定和生物信息学分析;以3个多分枝材料和3个少分枝材料为研究对象,提取不同生育期组织部位的总RNA,利用qPCR对BnFAF基因进行了表达模式分析.结果显示,甘蓝型油菜中共有17个BnFAF基因,分布在13条染色体上;基于氨基酸序列的相似度,参考拟南芥(Arabidopsis)FAF基因将BnFAF基因分为Ⅰ～Ⅳ共4个亚家族;基因结构、蛋白结构鉴定表明Ⅳ家族成员的分化较大,而其余亚家族内成员相对保守.qPCR分析发现,BnFAF4-4和BnFAF4-7的表达模式一致,且在多分枝材料薹期茎、上部腋芽和中部腋芽中的相对表达量显著高于少分枝材料,推测这些基因可能影响分枝的形成.本研究为进一步利用FAF基因改良甘蓝型油菜分枝性状提供了理论指导.