基于计算机分子模拟技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂

• 作者: 刘治国 崔文强 魏叶 朱心瑶 杨雪
• 来源期刊: 国际医药卫生导报
• 关键词: 2型糖尿病 PPARγ 计算机虚拟筛选 分子对接
• 年，卷（期）: 2022,（9）
• 所属期刊栏目: 科研课题专栏
• 页码范围: 1204-1208
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-1245.2022.09.005

摘要

目的:采用分子对接技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂。方法:研究时间为2021年1月至9月。基于过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARγ）的PDB晶型结构（PDB Code：6md4），构建虚拟靶标模型，以天然产物数据库中的1 680个化合物为配体筛选对象，以6md4原配体分子为对照。首先采用SYBYL软件对天然小分子化合物进行虚拟筛选，随后对排名前20位的化合物进行高精度分子对接，最后再使用PyMol软件分析结合稳定的化合物。结果:根据评分结果并结合冲突、极性和相似度，最终筛选出橙皮苷等20个小分子PPARγ激动剂，其中橙皮苷能够与PPARγSer289、His323、Tyr327等多个氨基酸形成氢键，结合良好。结论:从天然产物中筛选出潜在的PPARγ激动剂，为发现新型抗糖尿病的先导化合物或膳食补充剂提供基础。