干巴菌菌丝体与原基的比较转录组学分析

• 作者: 李鹏宇 胡骐验 邵娅丽 杨正一 赵梦婷 胡瑛琳 丁梓洲 沙涛 .云南大学生命科学学院省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室 .云南省人口和计划生育科学技术研究所
• 来源期刊: 中国食用菌
• 关键词: 干巴菌;原基形成;转录组;生长发育;外生菌根真菌
• 年，卷（期）: 2025,（5）
• 页码范围: 62-70
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13629/j.cnki.53-1054.2024.05.011

摘要

干巴菌是云南省一种重要的野生食用真菌，但其发育过程的相关分子机制尚未被揭示。研究旨在以干巴菌G46号菌株基因组作为参考基因组，对干巴菌菌丝体、干巴菌原基进行转录组测序及有参分析。结果表明，差异表达基因（DEG）总数为4 197个，2 051个上调，2 146个下调。GO富集分析表明，DEG在生物过程的多个条目中呈现出显著的富集现象，具体包括代谢过程、细胞过程以及单有机体过程等；在细胞组分的分类中，DEG显著富集于细胞、细胞部分、细胞器部分等条目；在分子功能的层面上，DEG还显著富集于催化活性、结合、转运体等关键条目中。这一发现揭示了DEG在生物体内具有广泛而多样的功能和作用。KEGG通路富集分析结果显示，DEG主要富集于MAPK信号通路、内质网中的蛋白质加工、氨基糖和核苷酸糖代谢通路等。内质网中的蛋白质加工、氨基糖和核苷酸糖代谢等途径相关DEG在原基期大部分上调表达。此外，共1 742个碳水化物活性酶（CAZymes）相关DEG表达，其中碳水化合物结合模块（CBMs）与糖苷水解酶（GHs）的DEG数量最多，分别占40.01%和29.56%。这些基因主要参与糖类底物降解，表明原基形成需要大量物质和能量。同时，降解木质纤维素的基因富集，暗示干巴菌的原基发育可能与其共生植物密切相关。