摘要:

为探究华重楼(Paris polyphylla var. chinensis)的叶绿体基因组特征，利用叶绿体系统发育基因组学方法，对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明，华重楼的叶绿体全基因组长158307 bp，由4个区组成，包括2个反向重复区(IRA和IRB，27473 bp)、1个小单拷贝区(SSC，18175 bp)和1个大单拷贝区(LSC，85187 bp)。其叶绿体基因组有115个基因，包括81个编码蛋白质基因、30个转运RNA基因和4个核糖体RNA基因。11种百合目植物的叶绿体全基因组的基因组成和基因顺序相似。华重楼的cemA基因是假基因，其起始密码子后有多聚核苷酸poly(A)及CA双核苷酸重复序列，编码序列中出现多个终止密码子,且与北重楼(Paris verticillata)的cemA编码序列中的终止密码子位置不同。因此，华重楼叶绿体基因组比较保守；cemA结构及假基因化现象可能具有重要的进化与系统发育信息，其编码序列中的终止密码子可以区分华重楼和北重楼。

摘要:

对第三纪孑遗濒危植物矮扁桃(Amygdalus nana)叶绿体全基因组进行结构特征分析,并探究其与近缘物种之间的系统进化关系.利用Illumina HiSeq Xten测序技术获取叶绿体全基因组序列,对其进行组装、注释和特征分析.结果 表明:①矮扁桃叶绿体全基因组总长度为158 596 bp,其中LSC长度为86 771 bp,SSC长度为19 037bp,2个IRs均为26 394 bp,为环状四分体结构.共注释130个基因,包括85个PCGs、37个tRNA和8个rRNA.②对6种植物进行IR边界区扩张和收缩分析,发现在4个边界区的基因类型和基因分布情况存在一定差异,并且亲缘关系越紧密差异程度越小.③在矮扁桃叶绿体全基因组中共预测了71个SSRs位点.④系统发育分析结果显示,在扁桃亚属中,矮扁桃在亲缘关系上与蒙古扁桃更近,而与长柄扁桃和榆叶梅的亲缘关系稍远.本研究对矮扁桃叶绿体全基因组进行了深度剖析,并且涉及大量被子植物的叶绿体全基因组资料,为桃属植物之间的进化关系和植物鉴定提供参考依据.