摘要:

目的 提高临床医师对皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎的认识.方法 对1例确诊为皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎患者的临床资料进行分析,并以"皮氏罗尔斯顿菌""脑膜炎"或"Ralstonia pickettii""meningitis"为检索词对中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据知识服务平台、维普中文科技期刊数据及生物医学文献数据库(PubMed)中的文献进行检索,对相关病例的临床资料进行总结.结果 该例患者因发热、头痛伴恶心、呕吐入院,通过宏基因组二代测序(mNGS)明确皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎诊断,经美罗培南抗感染治疗有效,其后好转出院,出院后无继续服用药物,出院后3个月随访无复发.在数据库检索到3例皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎患者,其中2例有颅内手术史、1例为早产儿,3例经积极的抗感染治疗均痊愈.结论 皮氏罗尔斯顿菌作为条件致病菌引起的颅内感染临床少见,mNGS技术的应用可提高该病的确诊水平.

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目的 分析微生物宏基因组二代测序(mNGS)在急性或亚急性脑炎或脑膜炎患者脑脊液中检出的DNA病毒特征和临床意义.方法 对疑诊急性或亚急性脑炎或脑膜炎并接受脑脊液mNGS的病例进行回顾性分析,按照临床诊断分组并比较各组检出的DNA病毒种类、特异序列水平[每1 M序列中的比对序列数(RPM)]和传统病毒病原学检查结果.结果 160例疑诊急性或亚急性脑炎或脑膜炎的病例分别有30例(18.8％)、85例(53.1％)和45例(28.1％)的临床诊断为病毒性脑炎或脑膜炎(不能区分DNA病毒和RNA病毒)、其他感染性脑炎或脑膜炎(细菌、真菌或寄生虫)和非感染性脑炎或脑膜炎(免疫炎性、肿瘤等),这3组中分别有8例(26.7％)、30例(35.3％)和8例(17.8％)检出DNA病毒.病毒性脑炎或脑膜炎组mNGS检出的病毒均为疱疹病毒,以单纯疱疹病毒1型、水痘-带状疱疹病毒和巨细胞病毒最常见,其RPM有很高的,但大部分均很低,去除RPM≥100的数据后,其平均RPM与非感染性脑膜炎组和其他感染性脑膜炎或脑膜炎组比较差异无统计学意义(P>0.05).除了1例有传统病毒病原学阳性结果和1例有很高的RPM支持其致病性,其他均无传统病毒病原学证据支持其致病性;而另外2组可以检出多种DNA病毒,以EB病毒、细环病毒和巨细胞病毒最常见,尤其是其他感染性脑炎或脑膜炎组,它们的平均RPM很低,而且均无传统病毒病原学证据支持其致病性.结论 急性或亚急性脑炎或脑膜炎患者的脑脊液中疱疹病毒和细环病毒等DNA病毒较为常见,尤其是感染性疾病中,mNGS有助于其检出和诊断,但对于占多数的RPM较低的结果,是否有致病性及临床意义,仍需结合临床分析作进一步解读.

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人类疱疹病毒7型（HHV-7）肺炎罕见。该文报道1例HHV-7肺炎病例，患者以咳嗽、咳痰、发热为临床表现，胸部CT表现为双肺片絮状密度增高影、结节伴晕征、进展空洞。常规抗感染治疗效果欠佳，后经支气管肺泡灌洗液（BALF）行宏基因组二代测序确诊，加用更昔洛韦抗病毒后病情好转。该例诊治提示，HHV-7肺炎临床症状不典型，影像学表现无特异性，对于早期抗感染治疗效果不佳的患者，应及时行BALF宏基因组二代测序检测有助于明确诊断。

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目的：通过Meta分析比较宏基因组二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing，mNGS)和GeneXpert MTB/RIF(简称“Xpert”)对结核病的诊断效能。方法：系统检索PubMed、Embase、Cochrane Library、Web of Science、中国知网(CNKI)、中国生物医学文献数据库(CBM)、万方和维普数据库自建库至2022年7月5日公开发表的关于mNGS与Xpert对结核病诊断准确性的文献。根据预先制定的纳入与排除标准，由2名研究者独立进行文献筛选、数据提取、偏倚风险和适用性评价，并对两种技术的诊断效能进行统计分析。 结果：最终纳入12篇文献共1344例患者资料。Meta分析结果显示，mNGS诊断结核病的合并敏感度、合并特异度、合并诊断比值比及AUC值分别为63.4%、99.8%、58.6和0.931，Xpert分别为50.3%、99.9%、23.8和0.860，两者并联诊断(mNGS+Xpert)分别为68.7%、99.8%、91.2和0.978。同时，mNGS对脑脊液组及其他肺外或多部位标本组的检测敏感度分别为64.6%和60.8%，Xpert分别为41.8%和50.8%。结论：mNGS和Xpert均具有结核病诊断应用价值，且mNGS和mNGS联合Xpert检测的总敏感度均高于Xpert，但三者特异度无差异。联合应用mNGS检测有望提高Xpert阴性但临床仍怀疑结核感染的病原检出率，尤其是肺外结核。

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目的 评价脑脊液宏基因组二代测序法在细菌性脑膜炎诊断中的应用价值.方法 回顾性分析山西某三级甲等医院2016年1月—2020年5月收治的细菌性脑膜炎病人,根据检测方法,分为脑脊液培养检测组及脑脊液宏基因组二代测序组.分析纳入病人的基本信息、病史、体征、实验室及辅助检查结果 等信息,比较两种检验方法在细菌性脑膜炎病人中的阳性检出率及两组的临床转归.结果纳入临床确诊的细菌性脑膜炎病人41例,其中39例行脑脊液培养,发现有6例明确病原菌,阳性检出率为15.38％;15例行脑脊液宏基因组二代测序,其中8例检出病原菌,阳性检出率为53.33％,两组间比较差异有统计学意义(P<0.05);41例病人中5例预后不良或死亡,1例复发二次入院,2例并发双耳听力下降.结论 宏基因组二代测序技术可作为细菌性脑膜炎的有效诊断方法,该方法较传统检验方法具有较高的敏感性,可早期明确致病菌,改善病人临床转归.

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目的 评价脑脊液宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在隐球菌脑膜炎诊断中的潜在应用价值.方法 回顾性收集北京协和医院2014年1月至2016年12月采用脑脊液mNGS技术辅助确诊的6例隐球菌脑膜炎患者临床资料,包括脑脊液常规、 生化、 细胞学、 培养、 墨汁染色等实验室检测结果,应用BGISEQ-100测序平台进行脑脊液病原测序,综合分析患者的临床、 实验室和辅助检查结果.结果 6例患者中,男性4例,女性2例,年龄26～53岁,中位年龄51岁.6例患者均无免疫缺陷性疾病,有头痛、 脑膜刺激症状及颅内压增高表现,5例患者出现发热,2例患者出现复视.脑脊液常规检查示白细胞和蛋白轻度升高,糖正常或轻度降低;5例患者脑脊液墨汁染色阳性,4例患者脑脊液隐球菌抗原检测阳性,2例患者脑脊液真菌培养阳性.脑脊液mNGS检测隐球菌核酸序数为108～25361,基因覆盖率0.19％～29.00％;5例提示新型隐球菌感染,其中3例经PCR检测证实为新型隐球菌感染;1例提示格特隐球菌感染,经生物质谱仪检测证实为格特隐球菌感染.结论 脑脊液mNGS技术可准确判断隐球菌感染,并对鉴别格特隐球菌具有一定优势,有助于降低免疫功能正常人群隐球菌脑膜炎的漏诊率.

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目的 分析微生物宏基因组二代测序(mNGS)在急性或亚急性脑炎或脑膜炎患者脑脊液中检出的DNA病毒特征和临床意义.方法 对疑诊急性或亚急性脑炎或脑膜炎并接受脑脊液mNGS的病例进行回顾性分析,按照临床诊断分组并比较各组检出的DNA病毒种类、特异序列水平[每1 M序列中的比对序列数(RPM)]和传统病毒病原学检查结果.结果 160例疑诊急性或亚急性脑炎或脑膜炎的病例分别有30例(18.8％)、85例(53.1％)和45例(28.1％)的临床诊断为病毒性脑炎或脑膜炎(不能区分DNA病毒和RNA病毒)、其他感染性脑炎或脑膜炎(细菌、真菌或寄生虫)和非感染性脑炎或脑膜炎(免疫炎性、肿瘤等),这3组中分别有8例(26.7％)、30例(35.3％)和8例(17.8％)检出DNA病毒.病毒性脑炎或脑膜炎组mNGS检出的病毒均为疱疹病毒,以单纯疱疹病毒1型、水痘-带状疱疹病毒和巨细胞病毒最常见,其RPM有很高的,但大部分均很低,去除RPM≥100的数据后,其平均RPM与非感染性脑膜炎组和其他感染性脑膜炎或脑膜炎组比较差异无统计学意义(P>0.05).除了1例有传统病毒病原学阳性结果和1例有很高的RPM支持其致病性,其他均无传统病毒病原学证据支持其致病性;而另外2组可以检出多种DNA病毒,以EB病毒、细环病毒和巨细胞病毒最常见,尤其是其他感染性脑炎或脑膜炎组,它们的平均RPM很低,而且均无传统病毒病原学证据支持其致病性.结论 急性或亚急性脑炎或脑膜炎患者的脑脊液中疱疹病毒和细环病毒等DNA病毒较为常见,尤其是感染性疾病中,mNGS有助于其检出和诊断,但对于占多数的RPM较低的结果,是否有致病性及临床意义,仍需结合临床分析作进一步解读.

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目的 提高临床医师对皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎的认识.方法 对1例确诊为皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎患者的临床资料进行分析,并以"皮氏罗尔斯顿菌""脑膜炎"或"Ralstonia pickettii""meningitis"为检索词对中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据知识服务平台、维普中文科技期刊数据及生物医学文献数据库(PubMed)中的文献进行检索,对相关病例的临床资料进行总结.结果 该例患者因发热、头痛伴恶心、呕吐入院,通过宏基因组二代测序(mNGS)明确皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎诊断,经美罗培南抗感染治疗有效,其后好转出院,出院后无继续服用药物,出院后3个月随访无复发.在数据库检索到3例皮氏罗尔斯顿菌脑膜炎患者,其中2例有颅内手术史、1例为早产儿,3例经积极的抗感染治疗均痊愈.结论 皮氏罗尔斯顿菌作为条件致病菌引起的颅内感染临床少见,mNGS技术的应用可提高该病的确诊水平.