马传染性贫血病病毒L株前病毒全基因组核苷酸序列分析

• 作者: 刘红全 孔宪刚 杨志彪 王柳 童光志
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 马传染性贫血病毒 L株 前病毒核苷酸 序列分析
• 年，卷（期）: 2001,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 690-696
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65+2
• 字数: 2874字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0578-1752.2001.06.020

摘要

本实验所用的马传染性贫血病毒(EIAV)L株(EIAV L)是我国研制成功的EIAV弱毒疫苗的原始强毒株.以EIAV-L感染马外周血液白细胞中DNA为模板,利用PCR技术,分4个片段扩增EIAV L前病毒DNA,并分别克隆到载体质粒pBluescript SK中,得到4个重组质粒p2.8、p2.4、p3.1和p1.2,经酶切鉴定后测序.对测序结果分析、拼接,得到EIAV L前病毒基因组全序列.EIAV L前病毒基因组全长8235bp,其中G+C含量为38%.通过使用计算机软件DNASIS分析,EIAV-L与马传贫驴强毒和马传贫驴白细胞疫苗毒序列同源性分别为98.4%和96.9%.同源性如此接近反映了它们之间的亲缘关系,另外EIAV-L与驴强毒的同源性高于其与驴白细胞弱毒疫苗株的同源性,这符合驴白细胞弱毒疫苗株的衍生过程.基因组两端是长为316bp的LTR,其中U3为197bp,R为80bp,U5为39bp.前病毒基因组有3个较大的开放阅读框架(ORF),分别编码gag、pol和env基因.gag基因位于71 3～1 91 2位碱基之间,全长1 200bp;pol基因位于1 708～5109位碱基之间,全长3402bp;env基因内出现一个框内终止密码子,使其分为两个部分,env1位于5305～6003位碱基之间,长为699bp;env2位于6073～7899之间,长为1 827bp.此外,前病毒还有3个小的ORF,S1位于5113～5265位碱基之间,长为153bp;S2位于5279～5 482位碱基之间,长为204bp;S3位于724 5～7646位碱基之间,长为402bp.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童光志	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	168	2158	24.0	40.0
2	孔宪刚	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	49	711	13.0	25.0
3	王柳	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	19	305	7.0	17.0
4	杨志彪	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	3	24	2.0	3.0
5	刘红全	中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室	3	27	2.0	3.0