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摘要:
重复DNA序列是细菌基因组中的一个重要组成部分,而ERIC(IRU)序列是在肠道细菌基因组中发现的一类基因间重复序列.本研究使用HMMER软件建立ERIC序列族的模型,并用该模型对46个已测序的菌株进行全基因组序列搜索,并对搜索结果进行比较分析,找出ERIC(IRU)序列在不同细菌基因组中的分布规律,即ERIC序列主要存在于肠道细菌中,并不是在细菌基因组中普遍存在的.
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内容分析
关键词云
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文献信息
篇名 ERIC序列在不同细菌基因组中分布的分析
来源期刊 山西大学学报(自然科学版) 学科 生物学
关键词 ERIC(IRU) 重复序列 HMMER 全基因组序列搜索
年,卷(期) 2002,(4) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 354-357
页数 4页 分类号 Q932
字数 2307字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.0253-2395.2002.04.021
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 赵立平 上海交通大学生命科学技术学院 82 1916 26.0 41.0
2 曹又方 山西大学生物技术研究所 2 143 2.0 2.0
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研究主题发展历程
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ERIC(IRU)
重复序列
HMMER
全基因组序列搜索
研究起点
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山西大学学报(自然科学版)
季刊
0253-2395
14-1105/N
大16开
太原市坞城路92号
22-42
1960
chi
出版文献量(篇)
2646
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12039
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:http://www.863.org.cn
项目类型:重点项目
学科类型:信息技术
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