ERIC序列在不同细菌基因组中分布的分析

• 作者: 曹又方 赵立平
• 来源期刊: 山西大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: ERIC(IRU) 重复序列 HMMER 全基因组序列搜索
• 年，卷（期）: 2002,（4）
• 页码范围: 354-357
• 页数: 4页
• 分类号: Q932
• 字数: 2307字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-2395.2002.04.021

摘要

重复DNA序列是细菌基因组中的一个重要组成部分,而ERIC(IRU)序列是在肠道细菌基因组中发现的一类基因间重复序列.本研究使用HMMER软件建立ERIC序列族的模型,并用该模型对46个已测序的菌株进行全基因组序列搜索,并对搜索结果进行比较分析,找出ERIC(IRU)序列在不同细菌基因组中的分布规律,即ERIC序列主要存在于肠道细菌中,并不是在细菌基因组中普遍存在的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵立平	上海交通大学生命科学技术学院	82	1916	26.0	41.0
2	曹又方	山西大学生物技术研究所	2	143	2.0	2.0