膜蛋白跨膜区预测方法的评价

• 作者: 刘琪 朱贻盛 李亦学 陈钟强
• 来源期刊: 生物化学与生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 膜蛋白 跨膜区 二级结构预测
• 年，卷（期）: 2002,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 285-290
• 页数: 6页
• 分类号: Q5
• 语种: 英文

摘要

基因组计划所产生的大量蛋白质序列迫切需要从理论上预测跨膜区. 对现有预测跨膜区的方法进行评价, 不仅可以帮助生物学家选择合适的方法, 而且可以为生物信息学家发展新算法提供指导. 采用了最新的膜蛋白数据库作为基本测试集合并选择了水溶性蛋白序列作为对照组, 对目前已经公开发表且提供网上服务的跨膜区预测方法进行了评价和分析. 经过分析比较, HMMTOP在所有的方法中综合预测效果最佳.