膜蛋白跨膜区段的预测分析

• 作者: 梁汝萍 莫金垣 谭学才 邱建丁 邹小勇
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 连续小波变换 跨膜螺旋区 疏水性 预测
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 页码范围: 831-836
• 页数: 6页
• 分类号: O657
• 字数: 4854字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0251-0790.2004.05.008

摘要

将连续小波变换技术的时频局部化特点和氨基酸的疏水特性相结合, 提出了一种用于预测膜蛋白跨膜区段数目和位置的新方法, 以代码为1YST的膜蛋白为例, 对小波尺度和疏水值的种类进行了选择, 同时描述了该法对跨膜螺旋区数目和位置的预测分析过程.从膜蛋白数据库中随机抽取36个蛋白质(含跨膜螺旋区232)作为测试集, 采用该方法对其跨膜螺旋区进行预测, 其中222个跨膜螺旋区能被准确预测, 准确率为96.1%.结果表明, 该法具有较高的预测准确性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹小勇	中山大学化学与化学工程学院	83	1011	19.0	28.0
2	莫金垣	中山大学化学与化学工程学院	188	2414	27.0	35.0
3	邱建丁	中山大学化学与化学工程学院	22	215	10.0	14.0
7	梁汝萍	中山大学化学与化学工程学院	31	298	12.0	16.0
11	谭学才	中山大学化学与化学工程学院	26	423	14.0	20.0