α-螺旋跨膜蛋白拓扑结构预测方法的评价

• 作者: 张莹 徐晓燕 方慧生 李娟
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: α-螺旋 跨膜蛋白 拓扑结构预测
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 259-263
• 页数: 5页
• 分类号: Q518.2
• 字数: 2555字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2012.04.07

摘要

在基因组数据中,有20％～30％的产物被预测为跨膜蛋白,本文通过对膜蛋白拓扑结构预测方法进行分析,并评价其结果,为选择更合适的拓扑结构预测方法预测膜蛋白结构.通过对目前已有的拓扑结构预测方法的评价分析,可以为我们在实际工作中提供重要的参考.比如对一个未知拓扑结构的跨膜蛋白序列,我们可以先进行是否含有信号肽的预测,参考Polyphobius和SignalP两种方法,若两种方法预测结果不一致,综合上述对两种方法的评价,Polyphobius预测的综合能力较好,可取其预测的结果,一旦确定含有信号肽,则N端必然位于膜外侧.然后结合序列的长度,判断蛋白是单跨膜还是多重跨膜,即可参照上述评价结果,选择合适的拓扑结构预测方法进行预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方慧生	中国药科大学生命科学与技术学院	28	84	6.0	8.0
2	张莹	中国药科大学生命科学与技术学院	6	23	3.0	4.0
3	李娟	南京鼓楼医院血液科	8	18	3.0	4.0
4	徐晓燕	中国药科大学生命科学与技术学院	3	7	2.0	2.0