新分离的无乳鼠神经毒力的登革2型病毒福建株基因组结构特征的研究

• 作者: 于曼 杨佩英 段鸿元 王鹏程 秦鄂德 耿丽卿 胡志君 苑锡同 范宝昌 赵卫 赵月峨 陈水平
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 登革2型病毒福建株 全基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2002,（4）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 422-426
• 页数: 5页
• 分类号: R37
• 字数: 4572字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2002.04.022

摘要

目的测定对乳鼠不致病登革2型病毒福建株(DEN2-FJ11)全基因组序列,探讨其基因组结构与功能关系. 方法采用RT-PCR和5′、3′端RACE方法测定病毒基因组的全序列,并运用DNASTAR软件的Clustal法将该毒株的序列与其它6株登革2型病毒进行比较,分析其进化关系. 结果 DEN2-FJ11株基因组全长10723个核苷酸,含有1个单一的读码框架,编码3391个氨基酸.5′、3′端非编码区(NCR)长度分别为96和454个核苷酸.DEN2-FJ11与同时分离的对乳鼠致病的FJ10株之间共有32个核苷酸不同及13个氨基酸的变化,其中8个氨基酸是其极性或电荷的改变.3′端非编码区134位的单个核苷酸变化导致其二级结构改变.DEN2-FJ11与FJ10株的核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.7%和99.6%,这2株病毒与印度尼西亚株亲缘关系最近,同为Ⅳ基因型. 结论 DEN2-FJ11株基因组与FJ10株及其它登革2型病毒株类似.位于病毒编码区的8个氨基酸差异及3′端非编码区134位的核苷酸可能与病毒的乳鼠神经毒力有关.