2012年1株南美洲输入登革1型病毒的基因组特征

• 作者: 吴生根 张拥军 王金章 翁育伟 黄萌
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 登革病毒 基因组序列 种系发生分析
• 年，卷（期）: 2013,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 665-670
• 页数: 6页
• 分类号: R373.9
• 字数: 1682字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2013.07.005

摘要

目的 分析2012年1株从南美洲输入登革1型病毒的基因组特征,探索登革病毒的传播规律.方法 测定DF1203毒株的全长基因组序列,分析该毒株与97株南美洲登革1型毒株的遗传联系,同时比较该毒株与全球最相似毒株的遗传联系.结果 DF1203毒株的基因组全长10 735个核苷酸,编码区全长10 179个核苷酸.种系发生分析显示,该毒株与南美洲登革1型毒株存在一定差异,BLAST分析表明DF1203与东南亚毒株存在密切遗传联系,尤其与近年柬埔寨毒株在种系发生树上处于同一分支.结论 虽然DF1203的患者来自南美洲苏里南,毒株遗传背景分析却显示与东南亚毒株存在亲密遗传关系.由此表明连续有效的登革病毒监测,尤其是检测分离株的部分或全部基因组序列,对于研究登革病毒传播路径、遗传进化,具有重要意义.