日本血吸虫一个新钙结合蛋白全长编码区的克隆与功能预测

• 作者: 彭鸿娟 王珣章 陈晓光
• 来源期刊: 中国人兽共患病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 日本血吸虫 基因功能预测 钙结合蛋白
• 年，卷（期）: 2002,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 47-49
• 页数: 3页
• 分类号: R383.2+4
• 字数: 2546字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2002.02.012

摘要

目的对用表达序列标签(Expression Sequence Tag,EST)策略从日本血吸虫尾蚴cDNA文库中筛选出的新基因进行功能预测.方法用NCBI 站点的BLASTx及BLASTn程序对所获得的新基因序列进行同源性搜索;用NCBI BLAST站点的blast two sequence程序对同源性高的基因进行核苷酸及氨基酸水平的同源性比较;利用motif scan in a Protein sequence对cDNA 序列所编码的蛋白质进行结构域搜索.结果发现一个与曼氏血吸虫尾蚴期特异性8kDa钙结合蛋白(Sm8)基因高度同源的日本血吸虫新基因,cDNA序列与氨基酸水平的同一性均为82%;蛋白结构域搜索结果显示,该cDAN序列所编码的蛋白质具有2个EF手钙结合位点.结论用EST策略筛选新基因是一个可行的方法,所筛到的日本血吸虫新基因编码一种钙结合蛋白,全长编码序列与Sm8基因高度同源,对该基因的期特异性及免疫保护性的探讨具有重要的意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈晓光	第一军医大学热带军队卫生学系寄生虫学教研室	59	689	17.0	23.0
2	彭鸿娟	中山大学生物防治国家重点实验室	4	21	3.0	4.0
3	王珣章	中山大学生物防治国家重点实验室	24	222	7.0	14.0