翻译速率与蛋白质二级结构的关系

• 作者: 刘次全 李晓琴 罗辽复
• 来源期刊: 生物化学与生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: mRNA序列 蛋白质二级结构 翻译速率
• 年，卷（期）: 2003,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 193-196
• 页数: 4页
• 分类号: Q5
• 语种: 英文

摘要

统计分析了人的119种蛋白质和大肠杆菌的92种蛋白质密码子翻译速率和蛋白质二级结构的关系. 据m-密码子片段在不同二级结构中的频数分布, 我们发现人和大肠杆菌中翻译速率与蛋白质二级结构之间有一定关系: 高翻译速率时倾向编码α螺旋、不倾向编码线团(coil); 低翻译速率时倾向编码线团、不倾向编码α螺旋; β折叠结构则随翻译速率表现出明显的振荡. 同时, 密码子的使用在不同片段内一般也是不均匀的: 在α螺旋片段内, 结构尾部偏向使用高翻译速率密码子; 中部倾向使用中翻译速率密码子; 而头部使用的密码子翻译速率偏低. 这样的倾向性不大可能归结为随机起伏的影响.