结肠正常黏膜和腺癌中差异表达基因的生物信息学分析

• 作者: 张昊 来茂德 谷雪梅
• 来源期刊: 浙江大学学报(医学版)
• 学科: 医学
• 关键词: 肠黏膜/病理学 腺癌/病理学 结肠肿瘤/病理学 基因表达 结肠腺癌 生物信息学 Linux
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 专题报道
• 页码范围: 95-101,124
• 页数: 8页
• 分类号: R735.35
• 字数: 6523字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9292.2004.02.002

摘要

目的:系统地分析由SSH方法获得的结肠正常黏膜和腺癌的差异表达基因.方法:构建基于Linux的核酸自动分析平台,对用SSH方法获得的3个文库之一的T-N差减文库进行分析.用半定量RT-PCR对部分结果进行验证.结果:成功构建了基于Linux的核酸自动分析平台,得到了15个contigs,其中与已知基因相匹配的有13个(T-N),未与已知基因匹配或者意义未明的有2个;部分基因的半定量RT-PCR发现,人胸腺素β4(Homo Sapiens thymosin beta 4,THY)和人乙型肝炎病毒x抗原反式活化蛋白2(Homo Sapiens HbxAg transactivated protein 2,XTP)的表达从正常黏膜-腺癌有逐步增高的趋势.结论:构建基于Linux的核酸自动分析平台是系统分析核酸序列的有效方法,根据对3个文库的系统分析结果,为进一步阐明结肠肿瘤分子机制提供了许多有价值的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张昊	浙江大学计算机系	15	70	5.0	8.0