犬冠状病毒V1株纤突蛋白全基因克隆与序列分析

• 作者: 乔军 夏咸柱 杨松涛 胡桂学 谢之景 闫芳 黄耕
• 来源期刊: 上海交通大学学报(农业科学版)
• 学科: 农学
• 关键词: 犬冠状病毒V1株 纤突蛋白基因 克隆与序列分析
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 页码范围: 266-271
• 页数: 6页
• 分类号: S858.93|Q785
• 字数: 3177字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-9964.2004.03.010

摘要

首次对犬冠状病毒(CCV)V1株纤突蛋白(S)基因进行了克隆和测序.根据GenBank中报道的CCV V54株S基因序列,设计了一对特异性引物,对CCV V1野毒株S基因进行了RT-PCR扩增.将扩增得到的PCR产物纯化后克隆到pGEM-T中得到重组质粒pTS,用于序列测定.结果该基因全长4362 bp,编码1453个氨基酸,N端前18个氨基酸为推测的信号肽序列,后1435个氨基酸构成成熟蛋白.将V1株S全基因与GenBank中已发表的6个CCV 毒株S基因进行了比较,结果核苷酸序列同源性在91.0%～99.0%之间;推导的氨基酸序列同源性在93.0%～99.0%之间;同时发现CCV变异区主要集中在S基因前1/2处,其中350-370、439-478、1718-1818三个区域碱基变异较大,而1060-1700区碱基却十分保守.基于S全基因聚类分析结果表明,S基因分型结果与CCV毒力强弱并不一致; V1野毒株推导的S蛋白潜在的N-联糖基化位点与CCV V54强毒相同,均为34个,比Insavc-1弱毒多一个;其中第566-568位糖基化位点是多数强毒拥有而弱毒Insavc-1没有的.推导的 V1株S蛋白疏水性及抗原表位与Insavc-1株有一定的差异,这些差别对病毒致病性和免疫原性等影响需进一步的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡桂学	吉林农业大学动物科技学院	185	837	15.0	21.0
2	杨松涛	中国人民解放军军需大学军事兽医研究所	12	52	4.0	6.0
3	夏咸柱	中国人民解放军军需大学军事兽医研究所	30	195	10.0	12.0
4	谢之景	中国人民解放军军需大学军事兽医研究所	6	54	4.0	6.0
5	黄耕	中国人民解放军军需大学军事兽医研究所	12	89	6.0	9.0
6	闫芳	中国人民解放军军需大学军事兽医研究所	11	16	3.0	3.0
7	乔军	中国人民解放军军需大学军事兽医研究所	6	18	3.0	3.0