敏捷气热菌密码子及AUG侧翼序列保守性分析

• 作者: 张光亚 方柏山
• 来源期刊: 华侨大学学报（自然科学版）
• 关键词: 敏捷气热菌 密码子使用偏好 AUG侧翼序列 碱基概率分布 保守性
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 学术论文
• 页码范围: 192-196
• 页数: 5页
• 分类号: Q933∶Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-5013.2004.02.021

摘要

比较敏捷气热菌和大肠杆菌等9种编码区GC含量,以及各异生物的密码子使用情况.结果表明,与敏捷气热菌编码区GC含量比较接近的果蝇,在密码子使用上与之相差最小.它们在分类学上分别属于不同的域,与敏捷气热菌同属古菌,但GC含量相差较大的强烈炽热球菌,则相差较大.说明编码区GC含量对密码子使用偏好,比生物分类学(系统发育)地位更重要.碱基A,C在高、低表达基因中出现的概率差别较大,尤其在-1,-3,-4和-7位点;碱基A,C在调控翻译起始效率中的作用,可能大于碱基G,U.因为碱基G,U在高表达和低表达基因中,其出现的概率差别不大.高表达和低表达基因起始密码子侧翼序列中,某些位点保守性存在差异,其中高表达基因-4位和-3位可能与其高表达特性有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方柏山	华侨大学材料科学与工程学院	137	975	15.0	23.0
2	张光亚	华侨大学材料科学与工程学院	88	491	10.0	20.0