敏捷气热菌起始密码子侧翼序列与密码子偏好及基因长度相关性研究

• 作者: 刘桂兰 张光亚 方柏山
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 敏捷气热菌 AUG侧翼序列 M1(1)值 AUGCAI值 密码子使用偏好
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 10-13
• 页数: 4页
• 分类号: Q933
• 字数: 3169字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2005.01.003

摘要

好氧超嗜热古菌敏捷气热菌(Aeropyrum pernix)mRNA中起始密码子AUG侧翼序列的保守性以及它与密码子使用偏好及基因长度之间具有相关性.AUG侧翼序列的保守性由M1(1)值表示,AUG侧翼序列对翻译起始的有效性由AUGCAI值表示.研究表明:高表达和低表达基因的-20位到+13位中某些位点的保守性存在差异,其中高表达基因的-4位和-3位可能与其高表达的特性有关;在A.pernix中一个普遍的趋势是:较短的基因有较高的表达效率,较长的基因的表达效率较低.与仅使用密码子偏好相比,将AUGCAI值引入到研究古菌在翻译水平上的自然选择更准确、更具有广泛适应性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方柏山	华侨大学生物工程与技术系	137	975	15.0	23.0
2	张光亚	华侨大学生物工程与技术系	88	491	10.0	20.0
3	刘桂兰	华侨大学生物工程与技术系	6	106	4.0	6.0