起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响

• 作者: 刘庆坡 薛庆中 谭军
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 水稻 起译密码子 侧翼序列 同义密码子偏性 基因表达水平 定点突变模拟
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 625-629
• 页数: 5页
• 字数: 4733字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0578-1752.2004.05.001

摘要

对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20～+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平.结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、8个(-19、-18、-14、-9、-6、-4、-1和+5)和7个(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6),其中只有-4和+5位点与CAI和CPP的值正相关,表明上述位点在转录水平上处于有利进化的自然选择压.对高表达的变应原蛋白基因7个特殊位点(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6)的碱基作定点突变分子模拟,其表达量分别降低63.3%和72.5%,显示了这些位点对基因表达的重要性.AUG侧翼序列适应指数(AUC CAI)与侧翼区的G+C含量呈高度正相关(f=0.625**)r表明在AUG侧翼富集G+C对翻译起始更有效.紧邻起译密码子AUG侧翼序列8个位点(-6～-1和+4～+6,除-4外)对G或C强烈偏好,暗示这是调节翻译起始效率以及同义密码子偏性的重要因素之一,尤其是在高表达基因中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘庆坡	浙江大学农业与生物技术学院农学系	10	177	7.0	10.0
3	薛庆中	浙江大学农业与生物技术学院农学系	86	2472	28.0	47.0
7	谭军		2	48	1.0	2.0