应用变性梯度凝胶电泳和16S rDNA序列分析对山羊瘤胃细菌多样性的研究

• 作者: Antoon D L Akkermans Barbara Williams Seerp Tamminga 姚文 朱伟云 韩正康
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 山羊瘤胃细菌 遗传多样性 PCR 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 16S rDNA
• 年，卷（期）: 2004,（9）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 1374-1378
• 页数: 5页
• 字数: 3449字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0578-1752.2004.09.020

摘要

以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上有匹配带的克隆的16S rDNA序列,并与现有的数据库进行了比较.结果表明,饲喂基础日粮时3头山羊瘤胃内容物的DGGE图谱有一定的相似性(43%～55%);饲料中添加大豆黄酮一定程度上影响了瘤胃细菌的组成,DGGE谱带变化程度分别为1号36%、2号46%、3号30%.基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有5个基因序列与基因数据库登录的相关序列的相似性大于97%,8个基因序列的相似性在90%～96%,余下的低于90%.相似性大于97%的5个克隆中,只有1个被鉴定为Prevotellasp.,其余4个都属于未被鉴定的瘤胃细菌.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩正康	南京农业大学消化道微生物研究室	130	2887	29.0	47.0
2	姚文	南京农业大学消化道微生物研究室	81	1511	20.0	37.0
5	朱伟云	南京农业大学消化道微生物研究室	155	2823	28.0	45.0
12	Antoon D L Akkermans	瓦赫宁根农业大学微生物系	1	109	1.0	1.0
13	Barbara Williams	瓦赫宁根农业大学动物系动物营养研究室	1	109	1.0	1.0
14	Seerp Tamminga	瓦赫宁根农业大学动物系动物营养研究室	1	109	1.0	1.0