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球毛壳菌部分表达序列标签的生物信息分析
球毛壳菌部分表达序列标签的生物信息分析
作者:
杨谦
金红星
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
cDNA文库
ESTs
球毛壳菌
生物防治
摘要:
球毛壳菌属于子囊菌门,是一种植物病害的广谱生物防治菌.为了解球毛壳菌的遗传背景和为生产上的应用打下基础,构建了球毛壳菌菌丝体的cDNA文库.测序产生了3507个可读序列,进一步分析时去掉小于100bp的短序列.用phrap软件对所获得的3116个表达序列标签(EST)进行拼接,生成387个contigs 和1023个singlets.BLAST分析表明513个单一基因是已知基因, 897个单一基因代表新基因.通过E-mail从国际DNA数据库(DDBJ)取得了1410条序列的登录号.从已知基因中鉴定了3类生物防治相关基因.研究结果表明,利用EST途径鉴定球毛壳菌的基因是非常有效的,而且能为生物防治分子机理和生物防治基因表达产物生产技术的研究提供重要线索.
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文献信息
篇名
球毛壳菌部分表达序列标签的生物信息分析
来源期刊
高技术通讯
学科
关键词
cDNA文库
ESTs
球毛壳菌
生物防治
年,卷(期)
2004,(7)
所属期刊栏目
生物与现代农业技术
研究方向
页码范围
34-37
页数
4页
分类号
字数
3274字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:1002-0470.2004.07.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
杨谦
哈尔滨工业大学生命科学与工程系
191
3458
29.0
49.0
2
金红星
哈尔滨工业大学生命科学与工程系
7
51
4.0
7.0
传播情况
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引文网络
引文网络
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节点文献
cDNA文库
ESTs
球毛壳菌
生物防治
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
高技术通讯
主办单位:
中国科学技术信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-0470
CN:
11-2770/N
开本:
大16开
出版地:
北京市三里河路54号
邮发代号:
82-516
创刊时间:
1991
语种:
chi
出版文献量(篇)
5099
总下载数(次)
14
总被引数(次)
39217
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
信息技术
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