利用生物信息学手段获得两个对硫磷水解酶

• 作者: 关雄 林毅 洪雪梅
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: Bacillus halodurans 对硫磷水解酶 生物信息学 农药降解
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 6-9
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 1967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2286.2004.01.002

摘要

以黄杆菌( Flavobacterium )对硫磷水解酶( parathion hydrolase)的序列(AAA24930.1)对芽孢杆菌的基因组进行BLASTP,从Bacillus halodurans中发现两个对硫磷水解酶类似蛋白PTEa和PTEb,长度分别为679和331个氨基酸.利用conserved domain search和motif scan软件分析的结果证实它们具有对硫磷水解酶的结构特征.PTEa和PTEb的对硫磷水解酶上游标志区分别是"GVCACHEHL"和"GFTYSHEHI",与标准的"G-x-T-L-x-H-E-H-[LIV]"大致吻合.PTEb的对硫磷水解酶下游标志区"AVARAHHETKAPIHSH"也与典型的"A-x-A-x-A-x(4) -G-x-P-[LIVM] -x(2) -H"基本一致,而PTEa中缺乏明显的下游标志区.PTEb序列对枯草杆菌基因组TBLASTN的结果表明枯草杆菌也可能存在对硫磷水解酶类似蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	关雄	福建农林大学生物农药研究中心	112	2066	21.0	43.0
2	林毅	华侨大学生物工程与技术系	42	230	10.0	13.0
3	洪雪梅	华侨大学信息学院	21	61	4.0	7.0