MPP并行机上数亿粒子规模的分子动力学模拟

• 作者: 张景琳 曹小林 莫则尧
• 来源期刊: 高技术通讯
• 关键词: 并行分子动力学 动态负载平衡 块-单元-链表
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 所属期刊栏目: 信息技术
• 页码范围: 10-13
• 页数: 4页
• 字数: 3657字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2004.05.003

摘要

提出一种基于"块-单元-链表"数据结构和HSFC动态负载平衡的并行分子动力学算法,实现了大规模、非均匀分子动力学模拟的基于MPI的可扩展并行计算,以辅助物理学家实现具有实验意义的纳米级模拟.具体地,在某MPP并行机的240个CPU上,计算3.84亿(二维)和2.76亿(三维)个粒子规模的金属微喷射问题,均获得了209倍以上的加速比.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张景琳	北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心计算物理实验室	9	132	6.0	9.0
2	莫则尧	北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心计算物理实验室	77	493	13.0	16.0
3	曹小林	北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心计算物理实验室	21	132	7.0	10.0