牙鲆淋巴囊肿病毒中国株(LCDV-C)羟类固醇脱氢酶基因的特征分析

• 作者: 严兴洪 张奇亚 曾首英 蔡生力
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 淋巴囊肿病毒中国株 虹彩病毒 羟类固醇脱氢酶 病毒基因结构分析
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 131-135
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 2690字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2005.02.009

摘要

属于虹彩病毒科的淋巴囊肿病毒(Lymphocystis disease virus,LCDV)是一类能引起全球各地上百种淡、海水鱼产生囊肿的病原.在新分离到淋巴囊肿病毒中国株(Lymphocystis disease virus isolate from China,LCDV-C)并完成序列测定的基础上,用计算机辅助分析了LCDV-C羟类固醇脱氢酶(hydroxysteroid dehvdrogenase,HSD)基因结构特征,LCDV-C HSD读码框为1 023bp,推导其编码含340个氨基酸、分子量约为39.3kD的蛋白质.对来自10个不同病毒株或物种的HSD蛋白序列进行的比较分析显示,LCDV-C与淋巴囊肿病毒代表株(LCDV-1)的HSD氨基酸同源性最高,为60.5%.对LCDV-C HSD的二级结构进行了预测,有亲水区5个,抗原区、α螺旋区和β折叠区各有6个.经密度排列界面(dense alignment surface,DAS)的方法预测,表明LCDV-C HSD有一个跨膜结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张奇亚	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	60	602	14.0	21.0
2	蔡生力		20	419	12.0	20.0
3	严兴洪		4	117	4.0	4.0
4	曾首英	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	2	6	1.0	2.0