肿瘤相关未知功能基因MGC39325的克隆及生物信息学分析

• 作者: 丁彦青 刘国炳 李亚玲 李学农
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 基因克隆 肿瘤相关基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2005,（9）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1059-1064
• 页数: 6页
• 分类号: R73
• 字数: 5300字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2005.09.004

摘要

目的:克隆与肿瘤恶性演进相关但未知功能的新基因MGC39325,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其功能.方法:应用RT-PCR技术从LoVo细胞中扩增MGC39325基因全长ORF,选用pGEM-T载体进行TA克隆,再将其亚克隆到真核表达载体pcDNA3.1(+)的启动子和终止子之间,通过PCR、限制性酶切分析及测序进行鉴定.应用生物信息学初步分析其染色体定位、蛋白序列、结构域及功能.结果:从LoVo细胞中扩增出1158 bp的cDNA,成功进行TA克隆并进一步亚克隆至pcDNA3.1(+)真核表达载体,测序证实为人MGC39325基因.生物信息学分析显示此基因定位于8q12.1,含有2个外显子(1113 bp),DNA序列含有表皮样生长因子位点标记(3-14,12-23)、整合素beta链半胱氨酸富集区位点标记(183-196)、铁氧化还原蛋白铁硫结合区位点标记(389-397,1027-1038)、第Ⅷ因子结构域位点标记(105-157,548-591)、羧基端胱氨酸结位点标记(744-782)等,编码由370个氨基酸组成蛋白质,Mr 40 727.9,pI值为9.45,疏水性平均值为-0.668,含3个低复杂性区域结构,氨基酸序列含有豆蔻酰化位点(19-24,130-135)、cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶(38-41,46-49,204-207)、酪蛋白激酶(49-52,158-161)、酪氨酸激酶(53-61)、蛋白激酶C磷酸化位点(97-99,140-142,208-210)、N-糖基化位点(97-99)等结构域,提示这一新的蛋白质可能在细胞生长、黏附及细胞信号转导方面具有重要功能.结论:成功地克隆了人MGC39325基因全长ORF,构建了其pcDNA3.1(+)真核表达载体,为进一步研究其功能及其肿瘤中的作用创造了条件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁彦青	南方医科大学病理学教研室	186	944	14.0	19.0
2	刘国炳	南方医科大学南方医院妇产科	38	140	7.0	9.0
3	李学农	南方医科大学病理学教研室	29	129	6.0	9.0
4	李亚玲	南方医科大学病理学教研室	5	23	4.0	4.0