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摘要:
以苋菜种子为初始材料,通过离体培养获得苋菜各阶段试管苗,利用实验室构建的苋菜开花过程转录组数据库(NCBI SRA number:SRR924089,SSR924090,SRR924091,SRR924092),采用RT-PCR结合RACE技术进行amaAG基因全长cDNA序列克隆,然后对其进行生物信息学分析.结果表明,苋菜amaAG基因全长为1123 bp,其中5′UTR 122 bp,3′UTR 243 bp,poly A尾长17 bp,并包含一个741 bp的开放阅读框,编码246个氨基酸.通过生物信息学分析可知,该蛋白属于亲水蛋白,但不是稳定蛋白;属于MADS和K-box超级家族,包含MADS_MEF2-like和K-box功能位点,与植物开花相关.amaAG基因差异表达分析表明,该基因是在开花期表达量最高.说明本研究已获得了苋菜amaAG基因,这为将来深入研究其功能奠定了基础,也为研究苋菜开花分子机制提供参考.
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文献信息
篇名 苋菜amaAG基因克隆与生物信息学分析
来源期刊 江西农业大学学报 学科 农学
关键词 苋菜 AG基因 克隆 开花 生物信息学
年,卷(期) 2017,(1) 所属期刊栏目 生物技术与工程
研究方向 页码范围 168-174
页数 7页 分类号 S636.4
字数 3697字 语种 中文
DOI 10.13836/j.jjau.2017022
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 赖钟雄 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 473 4127 31.0 41.0
2 刘生财 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 52 150 7.0 8.0
3 谢礼洋 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 7 11 2.0 2.0
4 柳燕 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 2 2 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
苋菜
AG基因
克隆
开花
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江西农业大学学报
双月刊
1000-2286
36-1028/S
大16开
江西省南昌市志敏大道1101号
44-102
1979
chi
出版文献量(篇)
4722
总下载数(次)
4
总被引数(次)
45526
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