版纳微型猪近交系GHR基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 施晨 曾养志 潘伟荣 王淑燕 霍金龙
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 版纳微型猪近交系 生长激素受体 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 48-56
• 页数: 9页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 5275字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2014.01.010

摘要

目的 获得版纳微型猪近交系(BMI)生长激素受体基因(GHR)序列,通过生物信息学分析预测GHR功能并进行GHR mRNA多组织表达谱分析.方法 以版纳微型猪近交系的肝脏组织为材料提取RNA,RT-PCR方法扩增GHR基因编码区序列,将序列连接至pMD18-T载体进行克隆、测序和生物信息学分析;半定量PCR检测GHR mRNA在BMI不同组织中表达量的差异.结果克隆出了BMI GHR 编码区序列,提交GenBank获得登录号KC999114.该基因CDS长1917 bp,编码638个氨基酸.生物信息学分析表明,与长白猪的GHR序列相比BMI存在4处氨基酸替换,分别为p.E381D、p.A409S、p.L556V和p.A580G,均发生在胞内域.GHR基因多组织表达谱分析显示:GHR mRNA几乎在各组织中均有表达,在肌肉中表达量最高,在小肠、心、肝、神经纤维、脾、卵巢中表达量较高,在肺、胃、大脑、胰和肾中的表达量较低.结论 成功克隆了版纳微型猪近交系GHR全长编码区序列,进行了生物信息学功能分析和组织表达谱分析,为进一步阐明版纳微型猪近交系生长矮小机理奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	霍金龙	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	70	426	11.0	15.0
5	潘伟荣	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	24	126	7.0	11.0
9	曾养志		82	854	16.0	25.0
10	王淑燕	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	5	11	2.0	3.0
14	施晨	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	1	8	1.0	1.0