版纳微型猪近交系BARD1基因克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析

• 作者: 张霞 王淑燕 王配 霍金龙
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: BRCA1相关联的指环蛋白1 版纳微型猪近交系 生物信息学 组织表达
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 103-109
• 页数: 7页
• 分类号: O78|S828.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2017.3291

摘要

BARD1基因在精子形成过程中起重要作用.以GenBank下载的牛、鼠BARD1基因序列以及猪EST序列克隆猪BARD1基因,设计特异引物克隆版纳微型猪近交系(BMI) BARD1基因.应用qPCR分析15个重要组织的mRNA表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树.研究获得了BMI BARD1 2 334 bp的编码区序列(GenBank登录号KU705640,对应的氨基酸登录号AOC89058),编码777个氨基酸,蛋白质分子量(Mw)为86.15 ku,等电点(pI)为8.84.多组织荧光定量表达分析表明:BARD1基因在睾丸和尿道球腺中高表达,在肝脏、脾脏、肺、十二指肠、结肠中中度表达,在心脏、肾脏、胃脏、脑、肌肉、精囊腺、前列腺、附睾中低表达.功能生物信息学分析表明,BARD1蛋白质存在3个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端亲水;有6类功能活性位点,位于细胞核的概率是94.1％.系统进化分析表明,BMI与牛、羊的亲缘关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	霍金龙	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	70	426	11.0	15.0
5	张霞	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	45	272	10.0	15.0
9	王配	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	7	8	2.0	2.0
13	王淑燕	云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室	5	11	2.0	3.0