版纳微型猪近交系 TDRP1基因克隆、鉴定及 mRNA 的组织表达特性

• 作者: 施晨 曾养志 查星琴 潘伟荣 王淑燕 王配 霍金龙
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 精子发生相关蛋白1 精子发生 版纳微型猪近交系 生物信息学 组织表达特性
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 9-16
• 页数: 8页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 4694字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2014.06.002

摘要

目的：克隆版纳微型猪近交系（ BMI）不育和可育公猪TDRP1基因，分析其序列及mRNA表达水平上的差异，预测其蛋白质功能，并检测该基因在可育公猪中的组织表达分布情况。方法以猪NM＿001198925序列为模板，设计特异引物，采用RT－PCR方法结合测序获得TDRP1的cDNA序列并进行生物信息学分析；采用半定量PCR方法检测TDRP1在不育和可育公猪睾丸中的表达规律，分析该基因在可育公猪17种组织中的表达特征。结果获得了BMI TDRP1基因的编码区序列（ GenBank登录号：KJ186786），生物信息学分析表明其编码186个氨基酸，蛋白质相对分子质量（ Mw）为20．49×103，等电点（ pI）为5．86，无信号肽，有94．1％的概率位于细胞核，含有1个亮氨酸富集的核输出信号。不同物种的氨基酸序列比对表明猪TDRP1与人、恒河猴、小鼠和大鼠等哺乳动物的TDRP1相似性在73％～83．2％之间，其中与人、恒河猴的相似性较高。 mRNA表达分析表明，TDRP1在BMI不育和可育公猪睾丸间表达水平差异无显著，在精囊腺和前列腺中高表达，在睾丸和小脑中中度表达，在大脑和肾脏中低表达，在其余组织中不表达。结论成功克隆了BMI TDRP1基因的全长编码区序列并发现了BMI特有的2个SNP位点；TDRP1基因在BMI不育和可育公猪间序列完全一致，睾丸mRNA表达水平差异无显著性，多组织转录谱分析表明该基因存在明显的组织差异表达现象，在精囊腺和前列腺中有较高表达量，为深入研究TDRP1基因在精子发生方面的作用奠定了基础。