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摘要:
目的:克隆版纳微型猪近交系( BMI)不育和可育公猪TDRP1基因,分析其序列及mRNA表达水平上的差异,预测其蛋白质功能,并检测该基因在可育公猪中的组织表达分布情况。方法以猪NM_001198925序列为模板,设计特异引物,采用RT-PCR方法结合测序获得TDRP1的cDNA序列并进行生物信息学分析;采用半定量PCR方法检测TDRP1在不育和可育公猪睾丸中的表达规律,分析该基因在可育公猪17种组织中的表达特征。结果获得了BMI TDRP1基因的编码区序列( GenBank登录号:KJ186786),生物信息学分析表明其编码186个氨基酸,蛋白质相对分子质量( Mw)为20.49×103,等电点( pI)为5.86,无信号肽,有94.1%的概率位于细胞核,含有1个亮氨酸富集的核输出信号。不同物种的氨基酸序列比对表明猪TDRP1与人、恒河猴、小鼠和大鼠等哺乳动物的TDRP1相似性在73%~83.2%之间,其中与人、恒河猴的相似性较高。 mRNA表达分析表明,TDRP1在BMI不育和可育公猪睾丸间表达水平差异无显著,在精囊腺和前列腺中高表达,在睾丸和小脑中中度表达,在大脑和肾脏中低表达,在其余组织中不表达。结论成功克隆了BMI TDRP1基因的全长编码区序列并发现了BMI特有的2个SNP位点;TDRP1基因在BMI不育和可育公猪间序列完全一致,睾丸mRNA表达水平差异无显著性,多组织转录谱分析表明该基因存在明显的组织差异表达现象,在精囊腺和前列腺中有较高表达量,为深入研究TDRP1基因在精子发生方面的作用奠定了基础。
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文献信息
篇名 版纳微型猪近交系 TDRP1基因克隆、鉴定及 mRNA 的组织表达特性
来源期刊 中国实验动物学报 学科 生物学
关键词 精子发生相关蛋白1 精子发生 版纳微型猪近交系 生物信息学 组织表达特性
年,卷(期) 2014,(6) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 9-16
页数 8页 分类号 Q95-33
字数 4694字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1005-4847.2014.06.002
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精子发生相关蛋白1
精子发生
版纳微型猪近交系
生物信息学
组织表达特性
研究起点
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相关学者/机构
期刊影响力
中国实验动物学报
双月刊
1005-4847
11-2986/Q
16开
北京市朝阳区潘家园南里5号
1993
chi
出版文献量(篇)
2300
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