猪TDRP1基因的电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 张伟 张细权 方梅霞 聂庆华
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 TDRP1基因 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 672-677
• 分类号: S828.8
• 字数: 3816字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1238.2010.00672

摘要

利用生物信息学和比较基因组学方法,对猪TDRP1基因的结构、表达及功能进行分析,结果表明:(1)电子克隆获得猪TDRP1基因cDNA部分序列共776 bp,包括119 bp的5′UTR、561 bp的编码区和96 bp的3′UTR,共编码合成187个氨基酸多肽;(2) 猪TDRP1基因CDS序列与人、小鼠和大鼠的同源性分别为85%、76.1%、77.1%.编码合成的猪TDRP1蛋白与人、小鼠、大鼠之间的同源性分别为82.5%、71.1%和70.1%;(3) 猪TDRP1蛋白的相对分子质量为20 489.8,不含信号肽,为1个可溶性蛋白,同时也是1个非分泌性蛋白,存在4个二级结构区段;(4) 基于cDNA及EST数据库的检索显示,猪TDRP1基因至少在卵巢和甲状腺等组织中表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方梅霞	暨南大学医学院	13	99	6.0	9.0
2	聂庆华	华南农业大学动物科学学院	46	386	13.0	18.0
4	张细权	华南农业大学动物科学学院	109	1363	19.0	31.0
6	张伟	华南农业大学动物科学学院	22	102	6.0	9.0