长白猪CIDEB基因真核表达载体构建及生物信息学分析

• 作者: 孙健 李红强 杜金友 王丽敏 郭振清
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: CIDEB 长白猪 真核表达载体构建 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 61-66
• 页数: 6页
• 分类号: S828.2
• 字数: 3764字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.20190508-06

摘要

本研究旨在从长白猪肝脏组织中克隆与脂质存储相关的CIDEB基因编码区全长序列,并进行生物信息学分析,为研究其结构和功能奠定基础.根据NCBI中的猪CIDEB基因mRNA序列(登录号:NM_001112688.1)设计特异性引物,采集长白猪新鲜的肝脏组织,提取RNA并反转录合成cDNA,以cDNA为模板进行PCR扩增,将PCR产物与pcDNA3.1+载体连接,转入大肠杆菌DH5α感受态细胞,筛选阳性克隆后进行生物信息学分析.结果显示:长白猪CIDEB基因编码区序列全长为660 bp,编码了219个氨基酸,与人同源性最高,为92.2％.对长白猪CIDEB蛋白进行生物信息学分析表明,CIDEB蛋白属于亲水性蛋白,不存在跨膜结构,属于CIDE-N家族成员之一,不同物种的CIDEB蛋白具有很高的保守性,其二级结构α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲分别占44.29％、18.26％、8.22％、29.22％.本实验成功构建了CIDEB基因的全长真核表达载体,并对其核苷酸、氨基酸进行序列分析,为进一步研究和揭示长白猪CIDEB蛋白的结构与功能提供了基础材料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王丽敏	河北师范大学生命科学学院	3	1	1.0	1.0