棉花乙烯受体基因的电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 潘玉欣 穆晓阳
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 乙烯受体基因 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（16）
• 页码范围: 8303-8307,8311
• 分类号: S562
• 字数: 4297字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2010.16.009

摘要

[目的]电子克隆并分析棉花乙烯受体基因(Ethylene Receptor,ETR).[方法]利用生物信息学方法,以毛果杨的ETR基因家族序列为基础,电子克隆棉花乙烯受体基因开放阅读框,并对序列进行氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、信号肽及系统进化等预测分析.[结果]通过电子拼接,共获得该基因家族的2个棉花ETR基因GhETR1和GhETR2.2个基因开放阅读框长度分别为2 289 bp和2 226 bp,编码含762和741个氨基酸残基的肽链.经生物信息学分析发现,两基因分属于ETR2和ETR1亚家族.N端有典型的跨膜区,含有ETR蛋白的保守域GAF、HisKA、HATPase-c和REC.GhETR1与毛果杨XP_002315717、XP_002311669 相似性较高,GhETR2 与毛果杨XP_002299688、XP_002327419相似性较高.[结论]该研究结果为进一步研究棉花GhETR基因在棉纤维发育中的作用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘玉欣		4	21	3.0	4.0
2	穆晓阳		1	1	1.0	1.0