版纳微型猪近交系PPP2CA克隆、表达及蛋白质功能生物信息学分析

• 作者: 张霞 李卫真 王淑燕 王配 霍海龙 霍金龙
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA) 版纳微型猪近交系 雄性育性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1737-1746
• 页数: 10页
• 分类号: S828.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.10.011

摘要

蛋白磷酸酶2A(protein phosphatases of the type 2A,PP2A)是一种广泛表达的丝氨酸/苏氨酸磷酸酶,介导蛋白质的去磷酸化从而调控多种关键信号通路的活性.该酶由催化亚基、结构亚基、调节亚基形成异源三聚体复合物发挥作用.本研究借助GenBank中猪(Sus scrofa)及其他物种的蛋白磷酸酶2A催化亚基α (protein phosphatase 2A catalytic subunit α,PPP2CA)mRNA序列,设计特异引物扩增版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)PPP2CA基因编码区序列,并对其进行表达和功能特性分析.应用qRT-PCR分析组织mRNA表达谱,并对编码的蛋白质序列进行生物信息学分析.扩增得到了BMIPPP2CA 930 bp (GenBank No.KU705627)的完整CDS序列,共编码309个氨基酸.与其他组织相比PPP2CA基因在尿道球腺和精囊腺中极显著高表达(P＜0.01),在睾丸中表达量也相对较高,在肝、结肠、脾、肺、十二指肠、前列腺、肾、附睾及脑中中度表达;在胃、心、肌肉中表达水平极显著低于其他组织.PPP2CA蛋白质功能预测表明其存在1个保守结构域MPP_PP2A_PP4_PP6,存在4类功能活性位点,无跨膜螺旋结构,无信号肽序列,N末端和C末端均亲水,位于细胞质的概率是94.1％.二级结构预测表明该蛋白α-螺旋含量最高,是组成N端的主要结构,C端有一段无规则卷曲,多物种氨基酸序列比对结果显示,PPP2CA序列在不同物种间相似度很高,推测其在进化中高度保守,为深入研究PPP2CA基因在猪精子获能方面作用机制提供了资料基础.