高凝状态大鼠主动脉表达上调新基因HCR2的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘秉文 白怀 赵玉华
• 来源期刊: 四川大学学报（医学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: HCR2全长cDNA cDNA末端快速扩增技术 巢式PCR 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2005,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 601-604
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 3373字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-173X.2005.05.001

摘要

目的获得高凝状态大鼠主动脉上调表达新基因HCR2的全长cDNA,并对该基因进行生物信息学分析.方法从高凝大鼠主动脉中表达显著上调的序列标签(EST,GenBank登录号为BQ901227)出发,利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA end, RACE)和巢式PCR技术扩增其全长cDNA,利用NCBI的数据库对其进行生物信息学分析.结果成功地获得了HCR2的全长cDNA,在GenBank中的登录号为AY234417.用RT-PCR证实HCR2是高凝大鼠表达上调基因.生物信息学分析显示,该基因cDNA序列全长为1275 bp,定位于大鼠染色体4q11,编码由78个氨基酸组成、相对分子质量为8841.7、pI为8.59的蛋白质;无信号肽序列和跨膜序列,很可能是一种核蛋白;与已知蛋白无明显同源性.结论 HCR2 的成功克隆为进一步研究其生物学功能及其在高血凝的发生、发展中的作用奠定了坚实基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘秉文	四川大学华西基础医学与法医学院生物化学与分子生物学教研室	47	275	10.0	13.0
2	赵玉华	四川大学华西基础医学与法医学院生物化学与分子生物学教研室	13	97	6.0	9.0
3	白怀	四川大学华西第二医院实验中心	44	192	9.0	10.0