基于二次判别的果蝇启动子识别

• 作者: 李前忠 林昊
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: polⅡ启动子 离散增量 二次判别函数 六联体
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 理论生物物理
• 页码范围: 345-350
• 页数: 6页
• 分类号: Q96
• 字数: 4146字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2006.05.006

摘要

通过对果蝇polⅡ启动子和非启动子的序列特征分析,计算了序列每个位点单碱基保守性M1(l)值和六联体保守性M6(l)值.从而分别选取两个区域的六联体频数作为离散源参数,利用离散增量结合二次判别函数(DQD)对启动子进行了预测.对于从编码区和内含子中选取的非启动子数据集,启动子的预测成功率分别达到93%和89%.比较结果显示IDQD模型能够有效地提高启动子预测成功率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李前忠	内蒙古大学理工学院物理系	87	366	11.0	15.0
2	林昊	内蒙古大学理工学院物理系	14	79	4.0	8.0