利用RAPD-PCR与ISSR-PCR标记技术分析长江口刀鲚的群体遗传结构

• 作者: 周志刚 张媛 胡则辉 陈亚瞿
• 来源期刊: 上海水产大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 刀鲚 遗传多样性 遗传变异 RAPD-PCR ISSR-PCR AMOVA
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 页码范围: 390-397
• 页数: 8页
• 分类号: S917|S931.5
• 字数: 4780字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-7271.2006.04.002

摘要

利用RAPD-PCR及ISSR-PCR两种分子标记技术对长江出海口两年3个群体的52条刀鲚(Coilia ectenes)进行群体遗传结构的分析.在3个群体中,利用RAPD-PCR标记技术,15个10 bp随机引物共检测到110条带,多态性为0.490～0.657,Shannon多样性指数为18.63～22.38,Nei平均遗传距离为0.1195～0.1454;而利用11个ISSR引物所获得的相应结果分别为67、0.576～0.682、11.56～13.66以及0.117～0.147.相关性分析表明这两种技术所获得的上述数据呈正相关(r=0.95,P＜0.05).AMOVA结果显示,3个群体按采集时间划分成的两年之间的遗传变异不超过总变异的1.1%,同一年内群体间的遗传变异也分别只占总变异的6.99%(RAPD-PCR)和2.75%(ISSR-PCR),群体内各个体之间的遗传变异占总变异的96%(P＜0.0001),说明两年内所采集的3个群体之间基本上没有产生遗传分化.基于样品之间的Nei遗传距离所构建的Neighborjoining聚类图也清楚地显示出没有按采样的时间产生群体的遗传分化.对各样品之间的Nei遗传距离及Neighbor-joining聚类图分别经Mantel检测及支序分析,发现ISSR-PCR技术所获得的结果与RAPD-PCR技术的结果不存在明显的正相关,但ISSR-PCR标记技术具有在待测样品中能检测到高多态性等优点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈亚瞿	中国水产科学研究院东海水产研究所	43	981	22.0	30.0
2	周志刚	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	10	154	6.0	10.0
6	胡则辉	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	3	85	3.0	3.0
10	张媛	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	3	135	3.0	3.0