目标序列二级结构对RNA干扰效果的影响

• 作者: 宋艳斌 张宝 燕翔 郑文岭 马文丽
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 生物学
• 关键词: siRNA N-RAS基因 K562细胞 二级结构
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 570-574
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 2181字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6325.2006.06.003

摘要

目的探讨RNA二级结构对RNA干扰效果的影响,为RNA干扰靶序列的选择及设计有效siRNA提供依据.方法以K562细胞为模型,N-RAS基因mRNA为模板,分别针对二级结构茎区及二级结构环区设计4对siRNA,并分别采用RT-PCR、细胞活力检测及流式细胞检测等方法在RNA及细胞水平检测干扰效果差异.结果干扰结果表明,针对目标序列的siRNA均能对同源基因的表达产生一定程度的抑制,而针对二级结构环区目标序列的siRNA干扰效果明显优于针对二级结构茎区的siRNA.结论RNA干扰效果与目标序列二级结构密切相关,在进行RNA干扰实验的目标序列选择时,应考虑二级结构的因素.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	南方医科大学分子生物学研究所	275	1255	15.0	23.0
2	郑文岭		94	308	8.0	12.0
3	张宝	南方医科大学分子生物学研究所	60	148	7.0	8.0
4	宋艳斌	南方医科大学分子生物学研究所	32	167	7.0	11.0
5	燕翔	解放军总医院肿瘤内科	7	80	5.0	7.0