基因芯片技术检测10种烈性RNA病毒

• 作者: 司炳银 吕富双 周东生 常国辉 杨瑞馥 杨银辉 祝庆余 翟俊辉 韩伟国
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 寡核苷酸序列分析RNA,病毒 检测
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 203-206
• 页数: 4页
• 分类号: R373|R44
• 字数: 3735字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0577-7402.2006.03.009

摘要

目的利用基因芯片技术检测包括披膜病毒科甲病毒属、黄病毒科黄病毒属、布尼亚病毒科汉坦病毒属及SARS病毒等10种烈性RNA病毒.方法设计了甲病毒属的属保守区通用引物和黄病毒属的通用引物,与布尼亚病毒及SARS病毒的引物一起用于扩增靶核酸.另外,在通用引物所能扩增的区域内设计每种病毒的特异引物,利用该引物通过PCR反应制备cDNA克隆探针,在判定其特异性后,制备氨基化探针.对探针浓度、杂交温度、杂交时间、不同杂交液及杂交后芯片的洗涤方法进行了优化.结果核酸探针浓度为0.3μg/μl时,可获得杂交信号;在杂交液终浓度含20%甲酰胺、杂交60℃、1.5h的条件下,可分别获得以上10种病毒的特异杂交信号.利用多重PCR扩增靶序列时,可获得2种或4种混合病原体的特异性杂交信号.结论利用基因芯片技术检测病毒性病原体是可行的,关键在于设计合适的引物及探针序列.