苏云金芽孢杆菌新基因cry1Ab17的克隆和生物信息学

• 作者: 关春鸿 关雄 邱君志 黄必旺 黄志鹏
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 苏云金芽孢杆菌 cry1Ab17基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 64-67
• 页数: 4页
• 分类号: Q785
• 字数: 3883字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1006-687X.2006.01.015

摘要

利用高效克隆PCR产物的专用载体pMD18-T,直接从苏云金芽孢杆菌WB9的PCR产物中克隆了cry1Ab17新基因.测序结果表明,该基因(GenBank登录号为AY646166)由3 471个碱基组成,其编码的蛋白质含有1 156个氨基酸残基,其中亲水性氨基酸占30.8%,疏水性氨基酸占45.2%,酸性氨基酸占12.9%,碱性氨基酸占11.1%.氨基酸序列的同源性分析结果表明,Cry1Ab17蛋白与已报道的Cry1Ab蛋白同源性为95.4%～99.7%,该蛋白的4个氨基酸残基--Pro170、Gly449、Gly796和Gly863与其它已报道Cry1Ab蛋白相应位置的氨基酸残基均不同.在核苷酸序列和氨基酸序列多重比较的基础上,应用PAUP 4.0构建了Cry1A蛋白家族的系统发育树.SignalP分析结果显示,Cry1Ab17蛋白中不含信号肽序列.此外,对Cry1Ab17蛋白的二级结构和3个结构域也进行了预测和分析.图4表2参15

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄志鹏	福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室	21	111	6.0	9.0
5	关春鸿	福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室	2	16	2.0	2.0
6	黄必旺	福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室	13	71	5.0	8.0
10	邱君志	福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室	30	150	7.0	10.0