变形虫穿孔肽及其类似物的结构表征与抗菌活性定量预测

• 作者: 李志良 熊清 王远强
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 生物学
• 关键词: 变形虫穿孔肽 按键分类的分子电性距离矢量 定量结构活性相关 多元线性回归 逐步回归
• 年，卷（期）: 2006,（10）
• 所属期刊栏目: 一、研究论文
• 页码范围: 1007-1012
• 页数: 6页
• 分类号: Q6
• 字数: 4830字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4160.2006.10.022

摘要

本文提出新的分子结构描述子-按键分类的分子电性距离矢量(B-MEDV)来表征变形虫穿孔肽及其类似物的分子结构,以对人类病原体Candida albicans的最低生长抑制浓度(MIC)的对数值为抗菌活性指标,借助多元线性回归(MLR)和逐步回归(SMR)建立定量结构活性相关(QSAR)模型.结果表明:所得模型相当稳定且有较强的预测能力;5种表征方案最优模型的相关系数为:0.94303、0.91167、0.90443、0.86581、0.94477;交互检验的相关系数为:0.73653、0.84285、0.81535、0.74451、0.83030.通过对比分析5种表征方案发现,多肽结构的特征主要表现在氨基酸的残基上,可以用残基的矢量描述子来表征整个多肽的结构,从而使表征过程更为简洁有效.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李志良	重庆大学生物工程学院	134	1393	19.0	33.0
2	王远强	重庆工学院生物工程学院	6	25	4.0	4.0
3	熊清	西南大学计算机与信息科学学院	3	10	2.0	3.0