人类群体遗传结构的图论主成分分析方法

• 作者: 王振光 王洁贞 胡平 薛付忠 郭亦寿
• 来源期刊: 中国卫生统计
• 学科: 医学
• 关键词: 人类群体遗传结构 图论主成分分析 HLA-A
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 19-23
• 页数: 5页
• 分类号: R1
• 字数: 5556字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-3674.2006.01.006

摘要

目的提出基因频率矩阵的图论主成分分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用.方法 从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将主成分分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论主成分模型,并以中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构分析为例,验证图论主成分分析的科学性和适用性.结果 图论主成分分析的基本步骤可概括为:①对中心化基因频率的协方差矩阵进行主成分分析;②按图论原理求过m维空间n个点的最小生成树;③利用求"颈"法分割最小生成树;④将最小生成树整合到二维主成分散点图中构建图论主成分分类图.根据此步骤,对中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构进行了图论主成分分析,分析结果符合中华民族源与流的客观规律.结论图论主成分分类图既可显示各群体的遗传结构特性,又可利用最小生成树的链接关系揭示各群体间的内在联系;图论主成分分析是分析人类群体遗传结构的一种较好方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王振光		28	117	6.0	9.0
2	王洁贞	山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所	90	883	14.0	22.0
3	胡平	山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所	42	291	10.0	13.0
4	薛付忠	山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所	126	878	15.0	21.0
5	郭亦寿	山东大学医学院医学遗传学研究所	17	66	5.0	7.0