恶臭假单胞菌丙氨酸消旋酶基因的克隆、序列分析及表达

• 作者: 丁久元 张英姿 曹芹 王宇 赵智
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 恶臭假单胞菌 丙氨酸消旋酶 基因克隆 表达
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 酶和蛋白质
• 页码范围: 80-84
• 页数: 5页
• 分类号: Q786
• 字数: 4288字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2006.01.017

摘要

从恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)200的基因组出发,用PCR方法克隆到两个独立作用的丙氨酸消旋酶基因,称之为dadX和alr.DadX编码357个氨基酸长的多肽,计算分子量为38.82kDa,alr编码409个氨基酸长的多肽,计算分子量为44.182kDa.序列分析显示,DadX的氨基酸序列与Pseudomonas putida KT2440,铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa),鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)和大肠杆菌(Escherichia coli)的DadX比较,相似性分别为96.64%、71.99%、44.88%和47.37%.Alr的氨基酸序列与Pseudomonas putida KT2440比较,同源性为94.38%,而与铜绿假单胞菌(P.aeruginosa)、鼠伤寒沙门氏菌(S.typhimurium)和大肠杆菌(E.coli)的Alr比较,同源性均较低,分别为22.89%、25.72%和26.44%.在P.putida 200的DadX和Alr氨基酸序列中部发现有对于酶活性至关重要的保守区域,如磷酸吡哆醛(PLP)结合位点.DadX和alr在大肠杆菌中得到表达,DadX丙氨酸消旋酶只对丙氨酸有消旋作用,而Alr丙氨酸消旋酶可以作用于丙氨酸和丝氨酸两种底物,且对丝氨酸特异性更高.Alr的表达不依赖于外源启动子,说明在其结构基因上游存在启动子结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王宇	中国科学院微生物研究所	211	1906	23.0	32.0
2	赵智	中国科学院微生物研究所	18	96	7.0	8.0
3	张英姿	中国科学院微生物研究所	19	119	8.0	9.0
4	丁久元	中国科学院微生物研究所	18	121	8.0	9.0
5	曹芹	中国科学院微生物研究所	3	25	3.0	3.0